肠道微生态研究已从物种组成层面深入至功能机制领域。肠道菌群借助代谢过程产生短链脂肪酸(SCFAs)等物质,对宿主的营养、代谢以及免疫功能进行调控,是肠 - X 轴研究的核心关键所在。凌恩生物针对 SCFAs 代谢进行了深度升级(产品升级!肠道宏基因组微生物营养代谢新方向!),能够精准评估菌群产生 SCFAs 的潜力,助力解析动物肠道菌群与宿主代谢之间的关联。
核心分析内容
(1)菌群组成与代谢物关联分析,构建 “产物-菌群”关联网络,挖掘核心功能菌群的代谢贡献。
多层环形堆叠图
热图
(2)脂肪酸合成基因分析:分析乙酸、丙酸、丁酸的关键合成基因,评估微生物的能量代谢能力。
柱状图
技术优势
高精度注释:整合最新数据库,提升低频物种和功能基因检出率;
多维度分析:从物种到功能,层层递进,结果更全面;
可视化丰富:提供柱状图、热图等多类图表,适配科研展示需求;
定制化服务:支持个性化需求,灵活调整分析策略。
凌恩项目案例
发表期刊:Marine Biology
样本采集:野生斑海豹粪便样本(n=18),圈养样本(n=20)。
产品类型:宏基因组
研究目的:本研究通过宏基因组学技术,比较野生与圈养斑海豹肠道微生物组的多样性、组成及功能差异,重点分析其在营养物质合成和先天免疫因子生成方面的能力差异,旨在为改善圈养斑海豹的健康状况提供科学依据。
主要结果:
(1)营养物质合成能力
挥发性脂肪酸(VFA):野生个体的乙酸、丙酸和丁酸合成基因(如poxB、tdcD)更活跃,表明其能量代谢更高效。
氨基酸(AA)与维生素:野生个体在精氨酸、色氨酸等代谢途径中更强,但圈养个体的维生素B1合成能力更高,可能与人工补充有关。
图1 斑海豹肠道菌群中VFA 生物合成相关基因分析[1]
图2 斑海豹肠道菌群中AA和维生素生物合成相关基因分析[1]
(2) 先天免疫因子合成
野生个体的IAA、IAId、犬尿氨酸和琥珀酸合成基因更丰富,表明其先天免疫力更强;而圈养个体的次级胆汁酸合成能力更高。
图2 斑海豹免疫因子合成菌群差异分析[1]
从物种组成到功能机制,从通路概览到关键基因精析。本次升级的肠道宏基因组营养代谢高级分析产品,旨在为您配备一把更锋利的功能挖掘利器。我们期待与您携手,在肠道微生态与宿主健康的研究领域中,发现更多未知,解锁更多可能。
参考文献
[1] Metagenomic insights into the differences in gastrointestinal microbe-mediated metabolism and immunity between wild and captive spotted seals (Phoca largha). Marine Biology.2024.