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AQUATOX模型是水环境与水生态模型。经过将近二十年的发展，该模型已经能够模拟河流、湖泊及水库等水体中富营养化，有机毒物的归趋等；同时，该模型能够有效的将水体水质与其中的藻类，底栖无脊椎动物及鱼类的生长等生态问题相联系。该模型也是生态学家，环境学家等模拟水质变化，评估生态风险的有效工具；被广泛的用于水体相关问题的研究中。AQUATOX模型理论复杂，涉及过程众多对其推广应用造成了阻碍。

第一章：AQUATOX模型基础理论
1、水环境和水生态模型的求解理论
2、AQUATOX模型的发展历程
3、AQUATOX模型的优点及其与其它相关模型的比较

4、AQUATOX模型的安装

第二章：AQUATOX水动力模拟

1、AQUATOX模型前处理
2、AQUATOX模型单河段模拟
3、AQUATOX模型多河段模拟

4、实操练习：FVCOM水动力算例试运行
第三章：湖泊富营养化模拟
1、AQUATOX富营养化模块的主要功能
2、AQUATOX中碳氮磷藻的转化及循环过程
3、AQUATOX富营养化模型主要参数

4、参数敏感性分析原理

第四章：富营养化模型操作
1、QUATOX富营养化模块输入数据的准备
2、AQUATOX富营养化模块参数的选择
3、AQUATOX富营养化模块的运行及后处理
4、富营养化模型参数的敏感性分析

5、综合案例，东部浅水湖泊的富营养化模型

第五章:毒物及水生态模型原理
1、AQUATOX中底栖及鱼类过程
2、AQUATOX中的毒物循环过程及主要参数
3、毒物在生物中的积累过程及其计算原理

4、AQUATOX中参数率定及验证

第六章：应用操作
1、AQUATOX水生态及毒物模型的运行及分析

2、运用AQUATOX模型计算水体毒物在生物中的积累
3、AQUATOX参数的率定和验证
4、综合案例，某湖泊中PCB的积累